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熒光原位雜交(FISH)在分辨率和探頭檢測再加上激光共聚焦顯微鏡時,都進一步提高了靈敏度的優點,并且是在成像細胞熒光標記的DNA和RNA序列的分布有價值的方法。 此外,標本成像系統公司明亮的熒光探針是目前可用于在兩個細胞核和染色體分離的總DNA的LSCM成像。
是可用的,當在相對簡單的協議成立,特異性染色某些細胞器的結構和大量的熒光探針。 其中可用的探針的過多的染料標記的核,高爾基體,內質網,線粒體和,并且還染靶向肌動蛋白聚合的細胞,如熒光標記的phalloidins。 這種染料是在多重標記方法非常有用的定位具有特定車廂在細胞權益抗原。
如果活細胞進行成像,但要注意的熒光染料加入到該系統的作用是至關重要的。 這些探頭可以是有毒的活細胞,尤其是當他們興奮的激光。 有毒的影響是通過加入抗壞血酸到細胞培養基中減少一些準備協議。 該標記的特定細胞成分可以在成像過程中影響細胞的活力。
例如,污漬的細胞核傾向于具有比細胞質染色更有害的影響。 探針可用,活的和死的細胞區分(這些之中,吖啶橙),并且可以在成像過程中使用的細胞活力測定。 大多數此類測定法是基于的前提是,死細胞的膜是可滲透的許多材料,如染料,不能穿透它們在活的狀態。
熒光-3和RHOD-2是已被合成,以改變在某些離子如鈣的存在下其熒光特性的染料的例子。 新的探針已經開發了用于成像的基因表達,包括,例如,水母綠色熒光蛋白(GFP),使基因表達和蛋白定位在體內被觀察到。標本成像系統公司利用綠色熒光蛋白基因,使基因表達的監測在許多不同的細胞類型,包括活果蠅卵母細胞,哺乳動物細胞和植物(使用激光共聚焦顯微鏡的激發激光的488nm的線)。 可用于在multilabeling實驗使用的GFP與頻譜發生變化的突變體,而這些也發現使用,以避免干擾自發熒光的活組織。